亚东县内三大寺庙分别是：1、东嘎寺，2、噶举寺，3、真桑寺。

1、东嘎寺

黄教寺庙，位于日喀则亚东县上亚东乡水电站西侧的一形似海螺的山坳上。

该寺大殿为二层建筑，一楼为八柱经堂，主供高约3米的强巴佛、金刚佛、阿底峡、宗咯巴等。经堂内置前世宝座。二楼走廊尽头悬挂有清朝驻防济南使所书的“光明世界”牌匾，殿堂有千尊宗喀巴殿、经堂、十四世达赖喇嘛与张经武将军会晤室等。

每年正月初一至十五期间，东嘎寺有晒大佛和酥油花灯节等活动。

2、噶举寺

该景点在亚乃公路沿线，距离亚东县18公里。该寺系木阁楼歇山式屋顶结构，始建于1747年，由噶举派僧人珠旺阿达和贡玛丹增创建。

寺院东西长50米、南北宽29米，四周砌以三米高的土坯砖墙，山门位于西墙南端。进门为一庭院。

大殿位于庭院东北部，坐北朝南，东西长25米，南北宽19米，平面呈“凸”字形，大殿正中为经堂。大殿原有两层，上层为噶举颇章（噶举派的宫殿）及活佛住房，“文革”期间被毁，1985年重新修复。该寺活佛共传承了十一代。

3、真桑寺

位于亚东县堆纳乡古汝村西侧约5公里处，距曲米辛古遗址11公里，距县城100公里。海拔4573米，建于公元15世纪初，由真桑活佛修建，属格鲁派寺庙。原来是尼姑寺后改为喇嘛寺。寺内有6个佛殿经堂，占地面积400平方米。由于该寺建在悬崖峭壁上，以险著称。

该寺长期以来承担着野山羊的饲养工作，山羊与僧人和谐共处，构成一幅独特的风景。