索南达杰自然保护站建立时间于1996年5月，是中国民间第一个自然生态环境保护站，海拔4479米，是五个保护站中建设最早、设施最全的一个。

长江北源楚玛尔河流域及周边地区是中国目前最大一片无人区之一的可可西里。可可西里平均海拔4500米，是中国青藏高原特有野生动物藏羚羊、野牦牛、藏野驴等最集中的地区。近年由于非法偷猎者的大量涌入，野生动物的数量急剧减少，当地政府因经费不足，保护野生动物的范围和力量也相当有限。

索南达杰自然保护站的名字来自于一个真实的故事：1994年1月18日，治多县西部工委书记索南达杰为保护藏羚羊，一人同18名偷猎者枪战，英勇牺牲。死后，他的身体还保持站立射击的姿势。