明万历二十七年（1599年），贵州播州土司杨应龙叛乱，祸及梵净。万历四十六年（1618年），梵净高僧妙玄和尚奏请明神宗重建梵净。此次重建五寺六殿：承恩寺、天池寺、三清殿、释迦殿、通明殿等，《敕赐碑》立于通明殿旁，成为梵净山“镇山之碑”。此次重建，使梵净山形成了“一大正殿、四大皇庵、六大脚庵，环山四大古寺”的格局。各寺厘定寺产，招纳僧户，修藏经塔。梵净山因惠沾皇恩，遂名震宇内，香火盛极一时。

梵净山是西南一座具有2000多年历史的文化名山，早在春秋战国时期，梵净山就属楚国“黔中地”，秦朝属“黔中郡”，汉代属“武陵郡”，以后一直是“武陵蛮”崇拜的神山、圣山。

梵净山（Mount Fanjing），得名于“梵天净土”，位于贵州省铜仁市的印江、江口、松桃（西南部）3县交界，靠近江口县城、印江县东南部、松桃县西南部。系武陵山脉主峰，是中国的佛教道场和自然保护区，位于铜仁地区中部。