武陵源风景名胜区森林覆盖率85%，

自然植被中，有维管束植物达193科、730属、1630种。其中木本植物107科、250属、700种，草本植物879种。木本植物中裸子植物7科、11属、17种；被子植物96科、286属、734种。

武陵源风景名胜区内

植物分布呈现多样性、过渡性、垂直性和古老性以及石峰上植被繁茂、种类繁多等特点。

树种以乔木为主，乔木、灌木和草木相混生；以常绿为主，常绿、半常绿和落叶并存；以天然林为主，天然林与人工林相间；以阔叶林为主，阔叶林与针叶林相混生。

据1988年初步调查，

景区内有古树17科、25种、55株。

其中：枫香7株，黄连木6株，枫杨4珠，缺萼枫香、樟树、桂花、柏木、武陵松各3珠，银杏、南酸枣、刺楸、黄心夜合各2株，其他12种树各1株。

武陵源风景名胜区境内有

兽类8目、21科、43种，属国家一、二类保护的13种。

有10目、24科、70种。以留鸟为主，兼有候鸟。属国家保护种类的13种，占境内鸟类总数的18.6%。两栖类动物2目6科12种。