蜈支洲岛古称古崎洲岛、牛奇洲岛，源于美丽的传说。

后在海南设立三亚市的时候，政府部门在核实各地地名的时候，当地渔民提供了一种说法，认为该岛很像一种名为蜈支的海洋生物，遂将该岛改名为蜈支洲岛，并沿用至今。

景区历史：

最早有关蜈支洲岛记录的年代在清朝。清光绪年间，海南有位游方道人吴华存遍游海南诸岛，希冀寻访炼丹修身之处。当他看到蜈支洲岛的风光旖旎和山海之间的万千气象，便欲在此结庐而居，炼丹修身。此事被当时的崖州知府钟元棣获悉，随即前往查看。

果见小岛风光与风水俱佳，认为如此宝地不应为个人所有，理当造福于民。于是他制止了吴道人的行为，由州府筹资在岛上修建了一处庵堂，取名为“海上涵三观”。

供奉的是中国汉字的创始人仓颉，这在国内亦属罕见，在海南的文化发展史上写下浓墨重彩的一笔，常留青史。 建庵时间为公元1893年，距今已有100多年的历史。